Weight evaluation of Tabapuã cattle raised in northeastern Brazil using random-regression models / Avaliação do peso de bovinos Tabapuã criados no Nordeste do Brasil utilizando-se modelos de regressão aleatória

The objective of this study is to compare random-regression models used to describe changes in evaluation parameters for growth in Tabapuã bovine raised in the Northeast of Brazilian. The M4532-5 random-regression model was found to be best for estimating the variation and heritability of growth characteristics in the animals evaluated. Estimates of direct additive genetic variance increased with age, while the maternal additive genetic variance demonstrated growth from birth to up to nearly 420 days of age. The genetic correlations between the first four characteristics were positive with moderate to large ranges. The greatest genetic correlation was observed between birth weight and at 240 days of age (0.82). The phenotypic correlation between birth weight and other characteristics was low. The M4532-5 random-regression model with 39 parameters was found to be best for describing the growth curve of the animals evaluated providing improved selection for heavier animals when performed after weaning. The interpretation of genetic parameters to predict the growth curve of cattle may allow the selection of animals to accelerate slaughter procedures.

Objetivou-se com esta pesquisa comparar diferentes modelos de regressão aleatória e determinar o mais adequado para descrever mudanças nos parâmetros de avaliação do crescimento de bovinos da raça Tabapuã criados no Nordeste brasileiro. O modelo de regressão aleatória M4532-5 foi definido como sendo o de melhor ajuste para descrição das estimativas de variância e herdabilidades das características de crescimento dos animais avaliados. As estimativas de variância genética aditiva direta aumentaram em função da idade, já as de variância genética aditiva materna mostraram crescimento do nascimento até próximo aos 420 dias. As correlações genéticas entre as quatro primeiras características foram positivas e de magnitudes moderada a alta. A maior correlação genética foi observada entre o peso ao nascer e aos 240 dias (0,82). A correlação fenotípica entre peso ao nascimento e demais características foi baixa. O modelo de regressão aleatória M4532-5 com 39 parâmetros apresentou-se como aquele de melhor ajuste para descrever a curva de crescimento dos animais avaliados. Resposta à seleção para obtenção de animais mais pesados será eficiente quando realizada em idades posteriores ao desmame. Ao se avaliar a curva de crescimento de bovinos por meio da interpretação dos parâmetros genéticos estimados, é possível selecionar animais com maior precocidade de abate.

Parâmetros e ganhos genéticos em características de crescimento de bovinos Tabapuã da Bahia / Parameters and gains in genetic characteristics of Bahia Tabapuã bovine Growth

Compararam-se dois modelos (com ou sem o efeito materno) na estimativa de parâmetros genéticos por meio do fator de Bayes (FB) e do critério de informação da deviance (DIC). Adicionalmente, avaliaram-se as tendências genéticas, maternas e fenotípicas em características de crescimento de bovinos da raça Tabapuã do estado da Bahia. O modelo que incluiu o efeito materno proporcionou menores valores de FB (167629,2; 117341,2 e 124804,8) e DIC (174550,0; 120242,7 e 128037,2) para pesos aos 205 (P205), 365 (P365) e 550 (P550) dias de idade, respectivamente. As estimativas médias, a posteriori, das herdabilidades diretas e maternas foram 0,33; 0,43 e 0,44 e 0,15; 0,14 e 0,16 para as três características, respectivamente. As tendências genéticas para o efeito direto foram de 0,4415 e 0,3613kg/ano para P205 e P365 e representam incrementos de apenas 0,25 e 0,15% nas médias das características ao ano. As tendências genéticas maternas para as três características demonstraram perdas e indicam ausência de seleção de matrizes para boa habilidade materna. Apesar de existir variabilidade genética suficiente para justificar ganhos genéticos via seleção, estes e os ganhos fenotípicos foram pequenos, sugerindo necessidade de melhorias genéticas e ambientais.(AU)

We compared two models (with or without maternal effect) in the estimation of genetic parameters through Bayes Factor (BF) and the Deviance Information Criterion (DIC). Additionally, we evaluated the genetic, maternal and phenotypic trends in Tabapuã bovine growth characteristics in the state of Bahia. The model that included the maternal effect provided smaller BF values (167,629.2; 117,341.2 and 124,804.8) and DIC (174,550.0; 120,242.7 and 128,037.2) for weights at 205 (W205), 365 (W365) and 550 (W550) days of age, respectively. The average estimates, a posteriori, the direct and maternal heritability (0.33, 0.43 and 0.44) and (0.15, 0.14 and 0.16) for the three characteristics, respectively. Genetic trends for direct effect were 0.4415 and 0.3613kg/year for W205 and W365 and presented increases of 0.25 and 0.15% in the average characteristics of the year. The phenotypic trend for W205 was 0.7039kg/year. Maternal genetic trends for the three characteristics showed losses and indicate absence of selection matrices for good maternal ability. Despite the magnitude of the estimated direct and maternal heritability, they indicate genetic gain opportunities, genetic and phenotypic trends indicated few direct gains and no gains for maternal ability.(AU)

A raça Gir Mocha na região Nordeste do Brasil: estrutura genética populacional via análise de pedigree / The Polled Gir Polled in Northeastern Brazil: population genetic structure via analysis of pedigree

Foram utilizados dados de pedigree de 2.558 bovinos da raça Gir Mocha nascidos no período de 1954 a 2005. As análises foram realizadas utilizando-se o programa Endog. Do total de animais estudados, 61,9%; 10,6% e 0,1% possuíam pedigree na primeira, segunda e terceira gerações, respectivamente.O número efetivo de rebanhos que forneceram machos reprodutores foi de 10,25 para pais e 3,87 para avôs, confirmando a baixa integralidade do pedigree. O número de animais fundadores foi de 975,5, e o número efetivo de fundadores de 141,34. O número de ancestrais na população referência foi de 924 animas, dos quais apenas 39 explicaram 50% da variabilidade genética da população.O coeficiente médio de relação foi estimado em 0,75%, sendo o maior coeficiente individual de 25%. O coeficiente de endogamia foi igual a zero de 1954 a 1984. Vale salientar que, neste período, estão incluídos os animais sem ascendência conhecida. A endogamia e o coeficiente médio de relação da população foram baixos, contudo podem estar subestimados em razão da pequena integralidade do pedigree.

In this study we used data from the 2558 pedigree cattle polled Gir born from 1954 to 2005. Analyses were performed using the Endog program. Of all animals studied, 61.86%, 10.56% and 0.10% had a pedigree in the first, second and third generation, respectively. The effective number of herds that provide breeding males was 10.25 for parents and 3.87 for grandparents, corroborating the low completeness of the pedigree. The number of founder animals was 975.5 and the effective number of founders were 141.34. The number of ancestors in the reference population was 924 animals from which only 39 accounted for 50% of the genetic variability of the population. The average relationship coefficient was estimated at 0.75%, the largest individual coefficient was 25%. The inbreeding coefficient was zero from 1954 to 1894. It is noteworthy that during this period included the population was low, but may be underestimated because of the small pedigree integrity.

Comparação de metodologias de seleção sob oscilação genética / Comparison of selection methodologies under genetic drift

Determinou-se o número adequado de repetições na comparação de métodos de seleção tradicionais e associados a marcadores moleculares, com diferentes tamanhos efetivos e sob diferentes sistemas de acasalamento dos reprodutores selecionados, usando simulação com o programa GENESYS. Para comparar os diferentes métodos de seleção utilizaram-se populações com tamanhos efetivos de 18,18 (TE1) e de 66,66 (TE2) e uma, 10 e 30 repetições por geração, avaliando-se os valores fenotípicos médios. Para as situações com apenas uma repetição, os resultados apresentaram incoerências, independentemente do tamanho efetivo (TE1 ou TE2) ou do sistema de acasalamento (RAA - reprodutores acasalados aleatoriamente, EIC - exclusão de irmãos completos ou EICMI - exclusão de irmãos completos e meio-irmãos). Observou-se que a oscilação genética influencia o ganho genético, principalmente, em populações com pequeno tamanho efetivo e que um valor mínimo de 10 repetições por geração é necessário para assegurar a consistência dos resultados obtidos pelos métodos de seleção.

This work was carried out to determine the required number of replicates for comparison of conventional and molecular marker-associated selection methods in distinct effective population sizes and different mating systems, by simulations using the software GENESYS. Effective populational size of 18.18 (ES1) and 66.66 (ES2), and one, 10, and 30 replicates per generation were used to compare the different selection methods, based on mean phenotypic values. Incongruences results were observed when a single replicate was considered independently of effective size (ES1or ES2) and the mating system (random mating; exclusion of full-sibs or exclusion of both full and half-sibs). Genetic oscillation influenced the genetic gain, mainly in populations of small effective size. Furthermore, at least 10 replicates per generation were required to obtain sound consistent results for both selection methods.

Fatores ambientais, genéticos e interação touro X fazenda sobre o peso aos 205 dias de idade de bovinos da raça nelore no estado de Mato Grosso do Sul / Genetic and environmental effects and interaction sire X farm on the weight to the 205 days of age in nellore cattle breeding in Mato Grosso do Sul State / El estudio de efectos genéticos y medioambientales y efectos toro x finca en el peso a los 205 días de edad en bovino de raza nellore engendrando en la provincia del Mato Grosso do Sul

Os objetivos neste estudo foram avaliar os efeitos ambientais e genéticos, e quantificar a influência da interação touro x fazenda na estimativa dos parâmetros genéticos, sobre os pesos aos 205 dias de idade (P205) em bovinos de corte. Foram utilizados dados de 17.242 animais da raça Nelore, criados a pasto, na região de Campo Grande – Dourados, MS, no período de 1978 a 1994. Utilizou-se dois modelos touros: um primeiro com causas de variação, onde foram incluídos no modelo estatístico os efeitos fixos de mês e ano de nascimento, sexo do bezerro,fazenda de criação, o efeito aleatório de touro e a covariável idade da vaca ao parto (linear e quadrática); um segundo, semelhante ao primeiro, onde foi adicionado o efeito de touro dentro de fazenda. Todas as causas de variação foram significativas (P<0,001). As estimativas dos parâmetros genéticos foram obtidas utilizando o aplicativo MTDFREML, através de dois modelos. O primeiro, completo contendo o efeito de touro, ambiente permanente de vaca e a interação touro x fazenda como efeitos aleatórios, além dos efeitos fixos de mês e ano de nascimento, sexo do bezerro, fazenda de criação; o segundo contendo os mesmos efeitos, porém sem a interação touro x fazenda. Os coeficientes de herdabilidade estimados para P205 foram 0,26 ± 0,04 quando utilizou o modelo touro sem o efeito da interação touro x fazenda; 0,07 ± 0,03 para o modelo com a interação; e 0,11 ± 0,01 valor estimado para o efeito não correlacionado da interação touro x fazenda. Os resultados obtidos indicam que os fatores de meio devem ser considerados por ocasião da seleção dos animais da raça Nelore aos 205 dias, na região estudada e que o uso da interação touro dentro de fazenda permite um melhor ajuste do modelo.

The objectives of study were to evaluate the environmental and the genetic effects and to quantify the infl uence of the sire x farm interaction upon estimates of genetic parameters for weaning weights (205 days of age - P205) in beef cattle. Data of 17,242 Nellore animals, raise on pastures in Campo Grande ­ Dourados region, Mato Grosso do Sul State, Brazil, from 1978 to 1994, were used. Two sire models were used. The fi rst one included as sources of variation the fi xed effects of month and year of the birth of calf, sex and farm; and the random effect of sire and the age of dam at calving (linear and quadratic) as a covariate. A second model was equal to fi rst, with the addition of the sire within farm effect. The estimates of genetic parameters were obtained through the application of MTDFREML with two models, a complete one, containing direct, maternal, permanent environment of dam and the interaction sire x farm as random effect, besides the fi xed effects already mentioned above, and a second one, that included the same effects except the interaction sire x farm. All sources of variation were signifi cant (P<0.001). The coeffi cients of heritability were 0.26 ± 0.04 for the sire model without sire x farm interaction; 0.07 ± 0.03 for the sire model with sire x farm interaction. The estimated value for the uncorrelated effect of sire x farm interaction was 0.11 ± 0.01. The results indicate that environmental factors must be considered on selection of the Nellore animals for P205 in the studied area and that the fi tting of sire within farm gave a better adjustment of the model.

Los objetivos fueron evaluar los efectos medioambiental, genético y cuantifi car la infl uencia de la interacción toro x fi nca en la estimación de los parámetros genéticos, en los pesos a los 205 días de edad (P205) en el ganado de carne. Se usaron datos de 17.242 animales de la raza Nellore, mientras engendrando en la pastura en la región de Campo Grande Dourados, Provincia del Mato Grosso Sul, en periodo 1978 a 1994. Fue usado dos modelos estadísticos, para realización de las análisis unicaracter en la característica P205, en uno incluyeron como efectos fi jos los grupos contemporáneos y la covarianza de la edad de la vaca al parto (linear y cuadrático) y como aleatorios los efectos genéticos toro y los efectos del ambiente permanente de la vaca, además del error residual. En otro incluyeron lo efecto toro x fi nca como aleatorio. Las estimativas de componentes de varianzas y heredabilidades fueron obtenidas por modelo toro a través del programa Multiple Traits Derivative Free Restricted Máximum Likelihood (MTDFREML). Todas las causas de la variación fueran signifi cantes (P <0,001). Los coefi cientes de herdabilidade para P205 fueran 0,26 ± 0,04 para el modelo sin el efecto de la interacción; 0,07 ± 0,03 para el modelo con la interacción y 0,11 ± 0,01 el valor de la interacción toro x fi nca. Los resultados obtenidos indican que los factores de ellos deben ser considerado por la ocasión de la selección de los animales de la raza Nellore, aos 205 diasde idade, en el área estudiada. El uso de la interacción del toro dentro de la fi nca permite un ajuste bueno del modelo.